土壤為覆於地殼最外圈之薄層，是由母質、氣候、生物、地形與時間等五個因子的綜合影響下，經漫長的風化及發育作用，所生成的自然體。隨著地形區的差異往往呈現出不同的土壤分佈。

（一）觀音山區

　　觀音山區土壤主要為灰棕或淺黃色表土，紅黃色底土，中細質地，土壤有機質含量低，呈強酸性反應，發育自安山岩或安山岩集塊岩，沖刷與風蝕均烈。由於植物覆蓋、侵襲及利用等關係，土層之深度及質地變異均大，土壤質地多粘重構造表層較佳，呈團粒鬆疏易通達；底層多塊狀而結構較密實，一般排水良好，沖蝕狀況則急峻處多嚴重。

（二）林口台地區

　　林口台地屬礫石層台地，厚達數十公尺，礫石以砂岩居多，因氣候高溫多雨，淋蝕作用旺盛，礫石層上部易受分解，多變為棕色粘土，夾含岩塊較小，最上層已化育為棕紅色土層，呈酸性反應。林口台地紅壤厚約數公尺至數十公尺，係台灣各台地紅壤層中之最厚者，依據粒度組成分析，可分為粉砂、粉粘土、粘壤土和壤土四類型。台地溪谷低處及下游一帶，地勢低平，沖蝕輕微，土壤多屬沖積土，表土多呈暗灰色。

（三）沖積平原區

　　五股鄉為淡水河左岸沖積平原區，土壤以砂質岩粘版混合沖積土為主，並攜其風化物堆積而成，質地多粘重，屬粉砂粘土，土層較深厚，一般排水不良，底層每呈藍灰色及其他斑紋，呈強酸性至微酸性反應，曾為台北縣主要栽培水稻的農地。沼澤區的土壤結構，上層為沈泥質黏土、砂質粒土及高塑性黏土組成，下層為沈泥質黏土和中間雜挾之沈泥質及砂質土壤或礫石組成。